Doktorego-ikasketak Biomedikuntza Ikerketarako Zentroan (Nafarroako Osasun Zerbitzua) burutu nituen, García-Foncillas doktorearen (Onkologia Saila, CUN) eta Lera doktorearen (Kirurgia Saila, Nafarroako Ospitalea) gidaritzapean. Nire doktorego-ikerketa koloneko eta ondesteko minbizia duten pazienteen fenotipo mutatzailean eta pronostikoan oinarritu zen. Prestakuntza Manel Esteller doktoreak zuzendutako PEBC-IDIBELL talde ospetsuan jaso nuen; bertan, ikerketa epigenetikoetarako funtsezko teknikak ikasi nituen, eta *WRN* genean (PNAS, 2006) zein minbizian MBD familiako proteinetan (Oncogene, 2008) gertatzen diren aldaketa epigenetikoen rolari buruzko ikerketetan parte hartu nuen. Gaur egun, ikerketa- eta arreta kliniko-arloetan dihardut. Ikerketa-arloan, Navarrabiomedeko Patologia Molekularreko Ikerketa Taldea zuzentzen dut; talde horrek minbizian —bereziki bularreko, koloneko eta ondesteko zein ginekologiako minbizietan— balio diagnostikoa, pronostikoa edo prediktiboa duten aldaketa epigenetiko berriak identifikatzea du helburu.
Geneen hipermetilazioa, miRNAen adierazpenaren desoreka eta histonen azetilazioa ikertzen ditugu; horretarako, teknika molekularrak (metilazio globalaren eta miRNAen adierazpenaren analisia, pirosekuentziazioa, etab.) erabiltzen ditugu azido nukleikoak (DNA eta RNA) eta proteinak aztertzeko, baita *in vitro* teknikak ere azterketa funtzionaletarako (ugalketa, inbasioa, etab.). Taldeak finantzaketa lehiakorra lortu du eskualdeko (Nafarroako Gobernuko Osasun eta Industria Departamentuak), nazioko (MINECO) eta Europako (RefBio, RefBioII, Onconet-Interreg Sudoe) erakundeetatik, besteak beste. Aurkikuntza garrantzitsuak egin ditugu garuneko tumoreetan, baita bularreko eta ginekologiako minbizietan ere, balio pronostikoa duten aldaketa epigenetikoei dagokienez. 2013az geroztik, Navarrabiomedeko Tumoreen Biobankuko Batzorde Zientifikoa zuzentzen dut. Diagnostikoaren eta pazienteen arretaren arloan, Patologia Saileko Patologia Molekularreko Laborategia zuzentzen dut 2009tik. Tumore solidoak dituzten pazienteengan minbiziaren tratamenduekiko erantzuna diagnostikatzeko eta aurreikusteko baliozkotutako biomarkatzaileak aztertzen ditugu, hainbat metodologia erabiliz; horien artean, belaunaldi berriko sekuentziazioa (NGS) dago. Gure laborategian lortutako emaitzak berehalako erabaki klinikoak hartzeko erabiltzen dira.
World's Top 2% Scientists (Stanford University)
1988an amaitu nituen Biologia Zientzietako graduko ikasketak Nafarroako Unibertsitatean. Ondoren, 1992an, Mikrobiologiako doktoretza lortu nuen Madrilgo Unibertsitate Autonomoko Biologia Molekularreko Zentroan (CSIC-UAM). Jarraian, hiru urte eman nituen ikerketan lanean Pascale Cossart irakaslearen laborategian (Institut Pasteur), *Listeria monocytogenes* bakterioaren aktinan oinarritutako mugikortasunaren genetikan arreta berezia jarriz.
1997an Espainiara itzuli nintzen, Iruñeko Nafarroako Unibertsitate Publikoan (NUP) mikrobiologiako irakasle gisa aritzeko. Hurrengo urtean, 1998an, mikrobiologiako irakasle-plaza finkoa lortu nuen, eta bakterioen biofilmen eraketa aztertzeko ikerketa-lerroa abiarazi nuen Agrobioteknologia Institutuan (NUPen eta CSICen arteko zentro mistoa). 2008an, Mikrobiologiako Katedra lortu nuen akreditazio-prozesu ofizialaren bidez, eta 2015aren amaieran, Navarrabiomedeko zuzendari-kargua hartu nuen; zentro hori Iruñean sortu berri zen ikerketa biomedikoko zentroa zen.
Beti izan dut gogoan ikerketa-emaitzak gizarteari helarazteko beharra eta garrantzia. Horrenbestez, 2011n, RECOMBINA S.L. bioteknologia-enpresa (Iruñea) sortzen lagundu nuen. Ikertzaile nagusi gisa aritu naiz Espainiako Ekonomia, Industria eta Lehiakortasun Ministerioak finantzatutako bederatzi proiektutan —segidan garatutakoak—, baita Europar Batasuneko lau proiektutan ere (6. eta 7. Esparru Programak). Nire ibilbidean zehar, 19 doktoregai zuzendu ditut; horietako batzuek beren ikerketa-taldeak gidatzen dituzte gaur egun.
Gaur egun, Patogenesi Mikrobianoaren Unitatea honako hauek argitzeaz arduratzen da:
- Staphylococcus aureus bakterioaren bi osagaiko sistema sentsorialaren funtzio orokorra.
- Salmonella enteritidis bakterioaren c-di-GMP bidezko seinaleztapen-sarea.
- Ondoko geneetatik datozen eta gainjarritakoak diren mRNAen bidezko erregulazio transkripzionala, eta RNase III entzimaren bidezko haien degradazioa.
- Biofilmen matrizeko osagaien sintesia.
Gure lanaren aurkikuntza nagusien artean hauek daude:
- Bap izeneko proteina-familia baten identifikazioa, hainbat bakterio-espezietan biofilmen eraketa sustatzen duena amiloide-konformazioa hartuz.
- Bi osagaiko sistema sentsorial hori ezinezkoa dela S. aureus hazkuntzarako laborategiko baldintzetan aurkitzea.
- Bakterioen transkripzio-kontrol mekanismo baten erakustaldia, inguruko geneetako mRNA-en gainjartzean eta ondoren RNase III jardueraren bidez degradatzean oinarrituta.
- Bakterioetan antolaketa genetiko berri baten identifikazioa, operon ez-jarraitua deitu duguna.
Nire ikerketa-interesak etengabe bideratu dira proteinen biokimikara eta proteomikara. Nire doktore-tesia (2005ean defendatua) steatohepatitis ez-alkoholikoaren eta karzinoma hepatozelularraren biomarkatzaileak proteomika bidez identifikatzera bideratu zen; garai horretan hiru patente lortu nituen.
Doktorego-ondoko aldian (2006–2010), EBren Seigarren Esparru Programako (FP6) proiektu batean parte hartu nuen, eta esperientzia handia lortu nuen proteogenomika-estrategietan, HSV-1ean oinarritutako bektore onkolitikoen potentzia eta segurtasuna hobetzeko helburuarekin. Nire prestakuntza zientifikoa osatzeko, ETEen Enpresa-kudeaketako Masterra egin nuen (2008). 2011n, Navarrabiomed ikerketa biomedikoko zentroan (Miguel Servet Fundazioa, Iruñea, Espainia) hasi nintzen lanean, proteinopatia neurodegeneratiboak karakterizatzera bideratutako ikerketa-unitate bat sortzeko; bertan, hainbat alderdi landu nituen, hala nola proteinen adierazpen-profilak, multiomika, itzulpen osteko aldaketak, sendagaien birkokapena eta sindrome neurologikoetan parte hartzen duten proteinen arteko elkarrekintzak.
Nire ibilbide zientifikoan zehar, 140 artikulu eta liburuetako 20 kapitulu baino gehiago argitaratzen lagundu dut, eta likido zefalorrakideoi zein garuneko proteomikari buruzko hiru liburu editatu ditut. Hamarkada bat baino gehiagoko esperientzia dut maila akademiko desberdinetako zientzialariak gidatzen eta haien tutore edo aholkulari izaten; biomedikuntzako estatuko hainbat Master-programatan irakasle aritu naiz, baita Nafarroako Unibertsitate Publikoko (NUP) Osasun Zientzien Sailean irakasle elkartu gisa ere, zazpi doktore-tesi eta Masterreko lan ugari zuzenduz.