Sara Palomino Echeverría, investigadora predoctoral de la Unidad de Bioinformática Traslacional de Navarrabiomed, realizará la lectura de su tesis por la Universidad Pública de Navarra el próximo jueves, 10 de octubre a las 13:00 h, en el salón de actos de Navarrabiomed.

El trabajo doctoral lleva por título “Unveiling Complex Diseases through Patient Stratification and Omics Analysis Acutely Decompensated Cirrhosis as a Case Study” y ha sido desarrollado en Navarrabiomed, bajo la dirección de David Gómez Cabrero, Investigador Principal de la Unidad de Bioinformática traslacional del centro y de Núria Planell Picola, Investigadora Postdoctoral en Machine Learning for Biomedicine de Cima Universidad de Navarra. 
 

Contexto y resultados de la investigación

Comprender las enfermedades complejas requiere métodos avanzados para entender su heterogeneidad inherente. Dos enfoques claves para desentrañar esta complejidad son (I) la estratificación de pacientes y (II) el análisis de datos ómicos. La combinación de ambos enfoques puede ayudar a identificar subgrupos de pacientes clínicamente relevantes y a elucidar las bases moleculares de la heterogeneidad de la enfermedad, contribuyendo en el avance hacia la medicina de precisión.

En esta tesis se pone el foco en la aplicación práctica de estos enfoques y se demuestra su efectividad en el contexto de la cirrosis descompensada aguda (AD), una enfermedad compleja con una variabilidad interindividual significativa. La investigación tiene como objetivo mejorar el pronóstico de los pacientes mediante estos métodos.
 

Financiación y difusión 

El trabajo doctoral de Sara Echevarría ha contado con financiación del Proyecto DECISION, iniciativa que se enmarca en programa de investigación e innovación Horizon 2020 de la Unión Europea y se ha difundido en Journal of Translational Medicine “A robust clustering strategy for stratification unveils unique patient subgroups in acutely decompensated cirrosis”. En la actualidad, también está en fase de revisión un artículo en Plos Computational Biology y otro en Journal of Hepatology. Además, la investigación ha dado lugar también a una herramienta bioinformática propia en R, disponible en Bioconductor: “ClustAll: Data driven strategy to find groups of patients within complex diseases”

Todos los hallazgos se han dado a conocer en foros del sector como The 21st International Conference on Systems Biology (Berlín, 2022), European Association for the Study of the Liver (EASL) Congress 2023, (Junio 2023). En este último, recibió el reconocimiento a mejor poster del encuentro. 

Sara Palomino continuará sus estudios de bioinformática en Finlandia durante los próximos dos años y medio mediante una beca postdoctoral (NORPOD-EMBL), concedida por la Universidad de Helsinki para especializarse en transcriptómica y proteómica espacial a nivel de célula única.